1.合成周期短，可以保證序列正確無誤。

　　2.基因合成具有更大的靈活性，可以對基因的酶切位點(diǎn)和基因序列進(jìn)行修改，方便下游的克隆和實(shí)驗(yàn)。

　　3.研究人員根據(jù)自己的意愿設(shè)計得到自然界中很難獲得甚至不存在的基因。

　　4.基因合成的基因可以進(jìn)行密碼子優(yōu)化，使基因在各種生物表達(dá)體系中都能得到良好表達(dá)。

　　48道基因合成儀使用的步驟如下：

　　1）仔細(xì)檢查合成儀上所有試劑瓶中的試劑量，必要時換掉試劑瓶，特別注意乙腈的量，因?yàn)樵撊軇┯昧枯^大。

　　2）將標(biāo)記好的清潔的收集瓶裝在合成儀上。

　　3）將要合成的DNA序列輸入合成儀。

　　4）檢查選擇的合成步驟是否正確。

　　5）選擇結(jié)束方法：TritylOffAuto是儀器的原始狀態(tài)，若打算以5，—DMT基團(tuán)連接純化寡核苷酸，將其轉(zhuǎn)變?yōu)門ritylOnAuto結(jié)束狀態(tài)。

　　6）選擇結(jié)束方法，一般為系統(tǒng)的原始狀態(tài)。

　　7）在每個柱監(jiān)視器的Username下，輸入你所希望的保存名字。

　　8）以代碼代替相應(yīng)的DNA序列標(biāo)記每一個收集瓶。

　　9）打印出每一個柱設(shè)置的詳細(xì)資料。

　　10）檢查打印出來的資料是否正確。

　　11）運(yùn)行StartColumn步驟檢查每一個柱的位置，確保合成儀上合成柱處于正確的位置。

　　12）檢查連接在合成儀上的溶劑殘留（廢液瓶）是否充滿。

　　13）如果分部收集器用來收集每個DMT脫保護(hù)步驟的流出物，確保試管充分清潔干凈，并打開分部收集器，確保DMT廢液管路通向分部收集器。

　　14）啟動循環(huán)，運(yùn)行開始程序清洗試劑管路，除去原來的試劑。